CANCERMOTISYS
Systembiologische Untersuchungen der Responseprädiktion beim Magenkarzinom
Koordinator: Dr. Julian Mattes
Das binationale Verbundprojekt CANCERMOTISYS („Systembiologische Untersuchungen der Wirksamkeit eines Krebstherapeutikums auf die Zellbeweglichkeit als Indikator der Metastasierung beim Magenkarzinom“) wurde von 2009-2012 vom Bundesministerium für Bildung und Forschung (BMBF) im Rahmen des Programmes „Medizinische Systembiologie-MedSys“ und seinem österreichischen Pendant BMWF gefördert. Es war das Vorläuferprojekt von SYS-Stomach.
Das wichtigste Ziel der Verbundpartner war die Untersuchung der individuellen Wirksamkeit des EGFR-Antikörpers Cetuximab in Magenkarzinomzellen, um effiziente Biomarker für die Wirksamkeit dieser zielgerichteten Therapie zu finden und im Rahmen einer personalisierten Medizin zu berücksichtigen.Dabei spielten in CANCERMOTISYS Methoden der Systembiologie eine zentrale Rolle, d.h., in einem interdisziplinären Ansatz werden mathematische Konzepte, computergestützte Verfahren und biologische Experimente im Zusammenspiel angewandt.
Partner des CANCERMOTISYS-Konsortiums
Dr. Julian Mattes (Koordinator), Software Competence Center Hagenberg GmbH, Hagenberg, Österreich
Swetlana Gaffron, Viscovery Software GmbH, Wien, Österreich
Prof. Dr. Rudolf Leube, Institut für Molekulare und Zelluläre Anatomie der RWTH Aachen, Aachen
Prof. Dr. Birgit Luber, Institut für Allgemeine Pathologie und Pathologie der Technischen Universität München
Dr. Dieter Maier , Biomax Informatics AG, Planegg
Dr. Peter Winter, GenXPro GmbH, Frankfurt am Main
Publikationen
Associating approximate paths and temporal sequences of noisy detections: Application to the recovery of spatio-temporal cancer cell trajectories. Dorfer M, Kazmar T, Šmíd M, Sing S, Kneißl J, Keller S, Debeir O, Luber B, Mattes J. Med Image Anal. 2015 Apr 29. pii: S1361-8415(15)00041-9. doi: 10.1016/j.media.2015.03.007. [Epub ahead of print] PMID:25987193
Monitoring the cytoskeletal EGF response in live gastric carcinoma cells. Felkl M, Tomas K, Smid M, Mattes J, Windoffer R, Leube RE. PLoS One. 2012;7(9):e45280. doi: 10.1371/journal.pone.0045280. Epub 2012 Sep 27. PMID:23028903
Association of amphiregulin with the cetuximab sensitivity of gastric cancer cell lines. Kneissl J, Keller S, Lorber T, Heindl S, Keller G, Drexler I, Hapfelmeier A, Höfler H, Luber B. Int J Oncol. 2012 Aug;41(2):733-44. doi: 10.3892/ijo.2012.1479. Epub 2012 May 14. PMID:22614881
Learning cellular texture features in microscopic cancer cell images for automated cell-detection. Kazmar T, Smid M, Fuchs M, Luber B, Mattes J. Conf Proc IEEE Eng Med Biol Soc. 2010;2010:49-52. doi: 10.1109/IEMBS.2010.5626299. PMID:21095879
