Angebote und Serviceleistungen

In der CEP werden folgende wissenschaftliche und technische Dienstleistungen angeboten (zum Teil in Kooperation mit der Gewebebank):

Projektberatung:

• Studiendesign und –planung, Modellauswahl
• Modellvalidierung
• Makroskopische und histologische Untersuchungen durch Veterinär- und Humanpathologen mit Expertise in Tiermodellpathologie/Labortierpathologie
• Kooperationsprojekte für wissenschaftliche Veröffentlichungen/Präsentationen

Gewebeprozessierung

• Paraffineinbettung und Anfertigung von Gewebeschnitten
• Gefrierschnitte
• Hämatoxylin-Eosin (HE) Färbung
• Spezialfärbungen (auf Anfrage)
• Immunhistochemie
• inSitu-Hybridisierung o DNA-/RNA Extraktion (in Kooperation mit der Abteilung für Molekularpathologie (auf Anfrage)
• Lasermikrodissektion (LMD, Leica)
• Gewebearchivierung (derzeit nur Paraffinblöcke)
• Light-sheet-fluorescence-Mikroskopie

Sektionsservice

• Kleine Labortiere
• Großtiere (nur auf Anfrage und vorherige Anmeldung)

Archivierung und digitale Verarbeitung

• Scannen und Annotieren von Gewebeschnitten
• Computergestütze Analyse (Definiens Tissue Studio®, Leica Aperio Algorithmen, QuPath)
• Digitale Slide-Datenbank (Aperio eSlide Manager, Leica)

Tiermodell-Gewebebank

• Erstellung von Tissue Microarrys (TMA) von Tiermodellen
• Asservierung von Normalgewebe von häufig genutzten Maus- und Rattenlinien

Training

• Kurse zu Gewebeentnahme und –asservierung
• 1-wöchiger Lab Animal Pathology Kurs im Rahmen des PhD-Programms „Medical Life Science and Technology”
• Kurse allgemeine und spezielle Sektionstechnik (Nagetiere)
• Regelmäßige theoretische Seminare „Grundlagen der Tierpathologie“
• Regelmäßige Vorlesung „Grundlagen der vergleichenden Pathologie bei tierexperimentellem Arbeiten“ im Rahmen des FELASA Aufbaukurses am ZPF
• Kasten „Normalgewebe und speziesassoziierte Erkrankungen“ zum Selbststudium (derzeit im Aufbau, nur gegen Gebühr/Pfand).

Spatial Omics

• Räumlich aufgelöste Transkriptomanalyse (Xenium in situ, 10x Genomics)
  • Einzelzell- und subzelluläre Auflösung
  • Gezielte Methode, die die Auswahl eines Genpanels voraussetzt. Derzeit ist die parallele Messung von hunderten RNAs möglich.
          
• Gemultiplexte Antikörperfärbung (CODEX/Phenocycler, Akoya Biosciences)
  • Paralleles Auslesen von hunderten Antikörperfärbungen
     
• Beide Methoden funktionieren sowohl mit Gewebeschnitten von FFPE-Proben als auch von gefrorenen (fresh-frozen) Proben.