Verbesserung der Gewebeprobenqualität für Diagnose und Therapie

Quantitative Bestimmungen von Proteinbiomarkern in klinischen Gewebeproben zur personalisierten Tumortherapie werden für den Erfolg einer Behandlung immer wichtiger. Die Einflüsse der Gewebeprozessierung, wie z.B. Entnahme, kalte Ischämie, Transport, Fixierung und Lagerung des Materials auf die Integrität, Stabilität und Expression von Proteinen in Gewebeproben sind nur unzureichend bekannt. Gesamtziel dieses Vorhabens ist, den Einfluss möglicher präanalytischer Variationen während der Gewebeprozessierung zu erfassen und zu minimieren, damit diagnostische Proteine in klinischen Gewebeproben genauer als bisher bestimmt werden können. 

Die Ziele im Einzelnen sind:

  • Erfassung der derzeitigen Schritte in der Gewebeprozessierung
  • Wie beeinflusst jeder Schritt die Stabilität, Integrität und Expression von Proteinen?
  • Untersuchung von posttranslationellen Modifikationen
  • Erarbeitung von Richtlinien zur Proteinuntersuchung klinischer Gewebeproben

In Zusammenarbeit mit dem Deutschen Institut für Normung (DIN) werden derzeit Technische Spezifikationen erarbeitet, die Empfehlungen für das Handling, die Dokumentation und die Prozessierung von Gewebeproben enthalten. Die Arbeitsgruppe Becker ist mit weiteren internationalen Experten insbesondere für Proteinanalysen von gefrorenen und Formalin-fixierten Gewebeproben zuständig. Diese Richtlinien werden im Normenausschuss "Qualitätsmanagement in medizinischen Laboratorien" erarbeitet.

Im Oktober 2015 sind die ersten Normen publiziert worden. Mehr....

Projektspezifische Publikationen

Gündisch S, Slotta-Huspenina J, Verderio P, Ciniselli CM, Pizzamiglio S, Schott C, Drecoll E, Viertler C, Zatloukal K, Kap M, Riegman P, Esposito I, Specht K, Babaryka G, Asslaber M, Bodó K, den Bakker M, den Hollander J, Fend F, Neumann J, Reu S, Perren A, Langer R, Lugli A, Becker I, Richter T, Kayser G, May AM, Carneiro F, Lopes JM, Sobin L, Höfler H, Becker KF. Evaluation of colon cancer histomorphology: a comparison between formalin and PAXgene tissue fixation by an international ring trial. Virchows Arch. 2014 Aug 2. [Epub ahead of print]

Gündisch S, Grundner-Culemann K, Wolff C, Schott C, Reischauer B, Machatti M, Groelz D, Schaab C, Tebbe A, Becker KF. Delayed times to tissue fixation result in unpredictable global phosphoproteome changes. J Proteome Res. 2013 Oct 4;12(10):4424-34. doi: 10.1021/pr400451z. Epub 2013 Sep 17. PubMed PMID: 23984901.

Gündisch S, Schott C, Wolff C, Tran K, Beese C, Viertler C, Zatloukal K,
Becker KF. The PAXgene(®) tissue system preserves phosphoproteins in human tissue specimens and enables comprehensive protein biomarker research. PLoS One. 2013;8(3):e60638. doi: 10.1371/journal.pone.0060638. Epub 2013 Mar 29. PubMed PMID: 23555997; PubMed Central PMCID: PMC3612043.

Gündisch S, Hauck S, Sarioglu H, Schott C, Viertler C, Kap M, Schuster T,
Reischauer B, Rosenberg R, Verhoef C, Mischinger HJ, Riegman P, Zatloukal K,
Becker KF. Variability of protein and phosphoprotein levels in clinical tissue
specimens during the preanalytical phase. J Proteome Res. 2012 Dec
7;11(12):5748-62. doi: 10.1021/pr300560y. Epub 2012 Nov 16. PubMed PMID:
23134551.

Viertler C, Groelz D, Gündisch S, Kashofer K, Reischauer B, Riegman PH,
Winther R, Wyrich R, Becker KF, Oelmüller U, Zatloukal K. A new technology for
stabilization of biomolecules in tissues for combined histological and molecular 
analyses. J Mol Diagn. 2012 Sep;14(5):458-66. doi: 10.1016/j.jmoldx.2012.05.002. 
Epub 2012 Jun 28. PubMed PMID: 22749745.

Braun M, Menon R, Nikolov P, Kirsten R, Petersen K, Schilling D, Schott C,
Gündisch S, Fend F, Becker KF, Perner S. The HOPE fixation technique--a promising
alternative to common prostate cancer biobanking approaches. BMC Cancer. 2011 Dec 7;11:511. doi: 10.1186/1471-2407-11-511. PubMed PMID: 22151117; PubMed Central
PMCID: PMC3248383.

Kap M, Smedts F, Oosterhuis W, Winther R, Christensen N, Reischauer B,
Viertler C, Groelz D, Becker KF, Zatloukal K, Langer R, Slotta-Huspenina J, Bodo 
K, de Jong B, Oelmuller U, Riegman P. Histological assessment of PAXgene tissue
fixation and stabilization reagents. PLoS One. 2011;6(11):e27704. doi:
10.1371/journal.pone.0027704. Epub 2011 Nov 16. PubMed PMID: 22110732; PubMed Central PMCID: PMC3218013.